Yugi Muto, um jovem com uma paixão por jogos, resolveu o antigo Enigma do Milénio Egípcio e agora hospeda uma alma dentro de si.
Com duas almas coexistindo dentro de um mesmo corpo, Yugi deve derrotar poderosos inimigos no jogo de cards "Monstros de Duelo" para desvendar os mistérios que rodeiam os Itens do Milénio e o segundo Yugi.